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Hard-filter阈值探究
GATK4官网给出的推荐阈值：For SNPs:
QD < 2.0
MQ < 40.0
FS > 60.0
SOR > 3.0
MQRankSum < -12.5
ReadPosRankSum < -8.0
For indels:
QD < 2.0
ReadPosRankSum < -20.0
InbreedingCoeff < -0.8
FS > 200.0
SOR > 10.0
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