BLUP与全基因组选择的示例分析
更新:HHH   时间:2023-1-7


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1. 作者及题目

 
 

2. BLUP是怎么起作用的?

很简单,通过构建混合线性模型,估计个体的育种值(BLUP),然后可以推断出子代的育种值应该是亲本的平均值。选择BLUP大的个体就行了。

 
 

3. 混合线性模型经典公式

简写矩阵形式:

MME形式:

 
 

4. BLUP值标准误的计算方法

 
 

5. 动物模型各元素的关系

R,G以及A,加性方差组分,残差方差组分的关系。

 

6. BLUP的准确性和可靠性

 
 
 

7. BLUP选择的优势

  • 可以容易的考虑固定因子
  • 构建A矩阵,考虑亲缘关系
  • 对不平衡性试验支持
  • 可以估计后代的值(根据亲本)    
 

8. BLUP的缺点

  • 方差组分不是已知的,有误差
  • 相对于大规模选择(mass selection),BLUP的方法容易增加近交系数    
 

9. BLUP的扩展

比如重复测量,母体效应,多性状模型等等

 

10. BLUP到GBLUP的过渡

 
 
 
 

11. 指数选择

 
 

12. GBLUP介绍

 
 
 
 

13. 基因组选择

 
 
 

14. 基因组选择的优势

 
 

15. 基因组选择适合的性状

 
 

16. 基因组选择与近交系数

  • 模拟数据显示,GS相对于传统BLUP,能够降低近交系数。因为孟德尔抽样误差可以被估计,这样相似度高的全同胞不会进行组配。
  • 但是,因为GS降低了世代间隔,每年的近交增量可能会比传统方法更大。
 
 

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