本篇内容主要讲解“pheatmap NA/NaN/Inf聚类错误怎么解决”，感兴趣的朋友不妨来看看。本文介绍的方法操作简单快捷，实用性强。下面就让小编来带大家学习“pheatmap NA/NaN/Inf聚类错误怎么解决”吧!

pheatmap 绘图出现报错信息类似：

Error in hclust(d, method = method) : 外接函数调用时不能有NA/NaN/Inf(arg11)

出现此类错误多数情况是数据在绘图过程中进行处理后 出现NA/NaN/Inf导致无法进行聚类。

其一是原数据中本身存在NA等情况，其二是原数据存在数据完全无变化，但pheatmap()函数中却选择了scale参数进行处理。例如其中一个基因（row）数值完全无变化，scale处理将产生NaN 之后外调hclust将无法成功

> A=c(1,1,1,1,1,1,1)
> scale(A)
     [,1]
[1,]  NaN
[2,]  NaN
[3,]  NaN
[4,]  NaN
[5,]  NaN
[6,]  NaN
[7,]  NaN
attr(,"scaled:center")
[1] 1
attr(,"scaled:scale")
[1] 0
> hclust(scale(A))
Error in if (is.na(n) || n > 65536L) stop("size cannot be NA nor exceed 65536") : 
  missing value where TRUE/FALSE needed

到此，相信大家对“pheatmap NA/NaN/Inf聚类错误怎么解决”有了更深的了解，不妨来实际操作一番吧！这里是天达云网站，更多相关内容可以进入相关频道进行查询，关注我们，继续学习！