megacc如何构建进化树.mao文件
更新:HHH   时间:2023-1-7


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基于linux版megacc构建系统进化树命令如下: -a输入的是构建进化树的参数 .mao文件 -d输入的是多序列比对之后的结果文件,可以是fasta格式 -o 是输出路径 其中一个重要的文件 也就是参...

基于linux版megacc构建系统进化树命令如下:

/biosoft/MEGA/megacc -a .mao -d fasta -o ./

-a输入的是构建进化树的参数 .mao文件

-d输入的是多序列比对之后的结果文件,可以是fasta格式

-o 是输出路径

其中一个重要的文件 也就是参数.mao文件的获取比较困难,蛋白序列、DNA序列以及建树基于的模型不同,具体的参数变换比较多,而linux下无法直接形成该文件,可以先借助Windows版megacc 先生成该文件。

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