Pacbio Sequel下机数据的示例分析
更新:HHH   时间:2023-1-7


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Pacbio Sequel 下机数据介绍

Pacbio Sequel 下机数据, 一般包括如下几个数据:

m54134_180724_220656.scraps.bam
m54134_180724_220656.subreads.bam
m54134_180724_220656.scraps.bam.pbi
m54134_180724_220656.subreads.bam.pbi
m54134_180724_220656.baz2bam_1.log
m54134_180724_220656.sts.xml
m54134_180724_220656.subreadset.xml
m54134_180724_220656.transferdone
m54134_180724_220656.adapters.fasta

文件的名称是有固定的编码形式的,以上面的数据为例:

m54134_180724_220656.subreads.bam
其中:

m: 是movie 的缩写

54134: 是设备的编号

180724_220656: 是测序运行的开始时间,为2018年07月24日22时06分56秒

subreads: 这部分是不同的数据类型,一般有scraps, subreads等

bam: 这是数据的格式,一般有bam格式,xml,fasta格式等

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